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データベースなど

BLAST
 DNA塩基配列やタンパク質アミノ酸配列の類似性検索

EzBioCloud
 微生物DNA・タンパク質の配列解析プラットフォーム

RDP Classifier
 16SrRNA遺伝子配列を用いた細菌の同定

BRENDA
 酵素のデータベース

CAZy
 糖質関連酵素のデータベース

PLSDB
 プラスミドのデータベース

REBASE: The Restriction Enzyme Database
 制限酵素と関連するタンパク質に関する情報を収集したデータベース

PubMLST
 100種類以上の微生物種・属の集団配列データと出自・表現型情報を統合したデータベース

ProkAtlas
 16S rRNA遺伝子配列から微生物生息環境を検索できるデータベース

MetaMetaDB
 様々な環境のメタゲノム(メタ・メタゲノム)をまとめたデータベース

微生物有害情報データベース(Microbial Risk Information Database: M-RINDA)
 NBRCが提供する微生物(細菌・真菌)に関する有害性情報の総合サイト

 

手法などに関するウェブサイト

微生物株の培養と保存
 niteのサイト

Primer3
 プライマーの設計

SignalP
 タンパク質中のシグナル配列の検索

BioRender
 生命科学関連のイラストをウェブブラウザ上で描画することができるツール

ChemSketch
 化学構造式描画ソフト

画像解析ソフトImageJの使い方 

MEGAを使って配列アラインメントおよび系統解析をする

Google Colab版公式のAlphaFold2.1 Notebook を使ってタンパク質立体構造予測をする

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